Seit 1868 befand sich auf dem Zugerberg das Kurhaus Schönfels. Um den Zugang zu erleichtern, gab es ab 1907 eine Tramlinie vom Bahnhof Zug bis zur Schönegg und von dort die Standseilbahn auf den Zugerberg. 1959 löste der Bus das Tram ab.

Seit der Eröffnung am 14. Mai 1907 wurde die Bahn öfters modernisiert:
1931 neue Wagen
1960 Talstation Schönegg
1971 Bergstation Zugerberg und Antrieb
1984 neue Wagen

2009 erfolgte der grosse Umbau für 7,4 Mio. Franken. Neue Panoramawagen und der vollautomatische Betrieb machen den Besuch dieser Standseilbahn in jeder Jahreszeit zu einem Erlebnis.

Im Jahr 2022 erfolgte die nächste, grosse Modernisierung: Das Trassee der Zugerberg Bahn wurde um 60 Zentimeter aufgeständert und ermöglicht so vor allem im Winter bei starkem Schneefall eine bessere Verfügbarkeit der Bahn. Bis anhin musste bei 20 Zentimeter Neuschneefall der Betrieb eingestellt werden. Dank dem erhöhten Trassee können nun Betriebsausfälle der Bahn sowie Schneeräumungsarbeiten am Trasse reduziert werden. Die Arbeiten wurden von Garaventa und Von Rotz & Wiedemar (Bauseilbahnen) ausgeführt.